Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CKAP5Q14008 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CKAP5Q14008 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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