Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms