Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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MKRN4PQ13434 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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