Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5B-203ENST00000373024 3060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STK31-202ENST00000355870 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NEFL-201ENST00000610854 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL3-201ENST00000264094 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX15-202ENST00000369429 3504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG5-201ENST00000340339 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO48-201ENST00000377957 5666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A8-208ENST00000490799 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM255A-201ENST00000309720 3394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 POP1-202ENST00000401707 4719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AZI2-212ENST00000479665 4706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN4-203ENST00000418658 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms