Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHD4Q14839 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms