Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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