Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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