Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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SKIV2LQ15477 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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SKIV2LQ15477 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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SKIV2LQ15477 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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SKIV2LQ15477 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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SKIV2LQ15477 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SKIV2LQ15477 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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