Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TNP2Q05952 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms