Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD11P31277 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD11P31277 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD11P31277 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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