Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms