Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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