Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms