Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms