Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms