Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms