Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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