Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2Q9UMS6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms