Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms