Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms