Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT172Q9UG01 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms