Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM8A1Q9UBU6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM8A1Q9UBU6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms