Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPG2Q9UBF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms