Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms