Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms