Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms