Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms