Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMOD3Q9NYL9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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