Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR7Q9NYK1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR7Q9NYK1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms