Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDAP2Q9NXN4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms