Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD8Q9NX08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COMMD8Q9NX08 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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