Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NLE1Q9NVX2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms