Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO28Q9NVF7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms