Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30AQ9NV96 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms