Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms