Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC4BQ9NT99 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms