Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms