Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOMER2Q9NSB8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOMER2Q9NSB8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms