Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms