Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTL1Q9NRR1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms