Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF4Q9NR80 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms