Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CYLDQ9NQC7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYLDQ9NQC7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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