Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFT1Q9NNX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms