Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TAF1DQ9H5J8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms