Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL3Q9H2J4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms