Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHARPINQ9H0F6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHARPINQ9H0F6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms