Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms