Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms