Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms