Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VN1R3Q9BXE9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms